As principais linhas de pesquisa do LIMA são Energia e Meio Ambiente (Avaliação de Impactos Ambientais do Sistema Energético, Energia Elétrica, Fontes Alternativas de Energia e Eficiência Energética, Petróleo e Gás Natural), Gestão Ambiental Empresarial e Pública, Avaliação Ambiental Estratégica e Mudanças Climáticas.

As atividades de pesquisa e ensino relacionadas às Mudanças Climáticas são conduzidas por pesquisadores do Centro Clima e abrangem dois eixos: Mitigação e Adaptação.